Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF2

Tubb2b, Tubulin beta-2B chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2bQ9CWF2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb2bQ9CWF2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb2bQ9CWF2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms