Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snw1Q9CSN1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms