Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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Pard3bQ9CSB4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Pard3bQ9CSB4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Pard3bQ9CSB4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Pard3bQ9CSB4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Pard3bQ9CSB4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Pard3bQ9CSB4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Pard3bQ9CSB4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pard3bQ9CSB4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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