Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms