Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RTRAFQ9CQE8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms