Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CQC3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CQC3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CQC3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CQC3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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