Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Use1Q9CQ56 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Use1Q9CQ56 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Use1Q9CQ56 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Use1Q9CQ56 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Use1Q9CQ56 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Use1Q9CQ56 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Use1Q9CQ56 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Use1Q9CQ56 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Use1Q9CQ56 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Use1Q9CQ56 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Use1Q9CQ56 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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