Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms