Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE9

Arl4d, ADP-ribosylation factor-like protein 4D, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl4dQ99PE9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Arl4dQ99PE9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arl4dQ99PE9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arl4dQ99PE9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arl4dQ99PE9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arl4dQ99PE9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arl4dQ99PE9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Arl4dQ99PE9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Arl4dQ99PE9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Arl4dQ99PE9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Arl4dQ99PE9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Arl4dQ99PE9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Arl4dQ99PE9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Arl4dQ99PE9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arl4dQ99PE9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Arl4dQ99PE9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arl4dQ99PE9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arl4dQ99PE9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arl4dQ99PE9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arl4dQ99PE9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arl4dQ99PE9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arl4dQ99PE9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arl4dQ99PE9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arl4dQ99PE9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arl4dQ99PE9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arl4dQ99PE9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arl4dQ99PE9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arl4dQ99PE9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Arl4dQ99PE9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arl4dQ99PE9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arl4dQ99PE9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms