Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim3Q99PE5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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