Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Mrpl3Q99N95 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mrpl3Q99N95 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms