Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Brms1Q99N20 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms