Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnpo2Q99LG2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnpo2Q99LG2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms