Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pagr1aQ99L02 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms