Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rab28Q99KL7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rab28Q99KL7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rab28Q99KL7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rab28Q99KL7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rab28Q99KL7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Rab28Q99KL7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab28Q99KL7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab28Q99KL7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab28Q99KL7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab28Q99KL7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rab28Q99KL7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab28Q99KL7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rab28Q99KL7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab28Q99KL7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab28Q99KL7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab28Q99KL7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab28Q99KL7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab28Q99KL7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab28Q99KL7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rab28Q99KL7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab28Q99KL7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab28Q99KL7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rab28Q99KL7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab28Q99KL7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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