Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Emc3Q99KI3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Emc3Q99KI3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms