Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Apobec3Q99J72 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms