Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ophn1Q99J31 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms