Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ctu1Q99J10 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ctu1Q99J10 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ctu1Q99J10 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctu1Q99J10 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms