Protein–RNA interactions for Protein: Q923W1

Tgs1, Trimethylguanosine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgs1Q923W1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgs1Q923W1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms