Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clip1Q922J3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms