Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Afg3l1Q920A7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Afg3l1Q920A7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Afg3l1Q920A7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms