Protein–RNA interactions for Protein: Q91XB0

Trex1, Three-prime repair exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex1Q91XB0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trex1Q91XB0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms