Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp3Q91W36 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms