Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms