Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms