Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE65

Taf12, Transcription initiation factor TFIID subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf12Q8VE65 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Taf12Q8VE65 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf12Q8VE65 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms