Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apol9aQ8VDU3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apol9aQ8VDU3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms