Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam20bQ8VCS3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fam20bQ8VCS3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms