Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh10Q8VCH7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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