Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup58Q8R332 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms