Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim29Q8R2Q0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim29Q8R2Q0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms