Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0H9

Gga1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga1Q8R0H9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga1Q8R0H9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga1Q8R0H9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga1Q8R0H9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga1Q8R0H9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga1Q8R0H9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga1Q8R0H9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga1Q8R0H9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gga1Q8R0H9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gga1Q8R0H9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gga1Q8R0H9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gga1Q8R0H9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gga1Q8R0H9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gga1Q8R0H9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gga1Q8R0H9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gga1Q8R0H9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gga1Q8R0H9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gga1Q8R0H9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga1Q8R0H9 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms