Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pitrm1Q8K411 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms