Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms