Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sde2Q8K1J5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sde2Q8K1J5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms