Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cldn34c1Q8K193 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cldn34c1Q8K193 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cldn34c1Q8K193 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cldn34c1Q8K193 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cldn34c1Q8K193 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cldn34c1Q8K193 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cldn34c1Q8K193 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Cldn34c1Q8K193 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
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Cldn34c1Q8K193 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn34c1Q8K193 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms