Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Q4Q8HWB2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms