Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Upp2Q8CGR7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Upp2Q8CGR7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms