Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Setd1bQ8CFT2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Setd1bQ8CFT2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Setd1bQ8CFT2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Setd1bQ8CFT2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Setd1bQ8CFT2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Setd1bQ8CFT2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Setd1bQ8CFT2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Setd1bQ8CFT2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms