Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms