Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc63Q8CDV6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms