Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

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Length 1,456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Lrrc9Q8CDN9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc9Q8CDN9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Lrrc9Q8CDN9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrc9Q8CDN9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrc9Q8CDN9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Lrrc9Q8CDN9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc9Q8CDN9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc9Q8CDN9 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Lrrc9Q8CDN9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc9Q8CDN9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Lrrc9Q8CDN9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc9Q8CDN9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Lrrc9Q8CDN9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Lrrc9Q8CDN9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Lrrc9Q8CDN9 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Lrrc9Q8CDN9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Lrrc9Q8CDN9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc9Q8CDN9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Lrrc9Q8CDN9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc9Q8CDN9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Lrrc9Q8CDN9 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Lrrc9Q8CDN9 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc9Q8CDN9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc9Q8CDN9 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Lrrc9Q8CDN9 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc9Q8CDN9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc9Q8CDN9 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc9Q8CDN9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc9Q8CDN9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc9Q8CDN9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc9Q8CDN9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms