Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

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Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc73Q8CDM4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms