Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc87Q8CDL9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc87Q8CDL9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms