Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms