Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CntrobQ8CB62 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CntrobQ8CB62 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms