Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB27

Yod1, Ubiquitin thioesterase OTU1, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yod1Q8CB27 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Yod1Q8CB27 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Yod1Q8CB27 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Yod1Q8CB27 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Yod1Q8CB27 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Yod1Q8CB27 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Yod1Q8CB27 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Yod1Q8CB27 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Yod1Q8CB27 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Yod1Q8CB27 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Yod1Q8CB27 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Yod1Q8CB27 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Yod1Q8CB27 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Yod1Q8CB27 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Yod1Q8CB27 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Yod1Q8CB27 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Yod1Q8CB27 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Yod1Q8CB27 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Yod1Q8CB27 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Yod1Q8CB27 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Yod1Q8CB27 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Yod1Q8CB27 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Yod1Q8CB27 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Yod1Q8CB27 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Yod1Q8CB27 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Yod1Q8CB27 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Yod1Q8CB27 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Yod1Q8CB27 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Yod1Q8CB27 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Yod1Q8CB27 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Yod1Q8CB27 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms