Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ccdc113Q8C5T8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ccdc113Q8C5T8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ccdc113Q8C5T8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ccdc113Q8C5T8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ccdc113Q8C5T8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ccdc113Q8C5T8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ccdc113Q8C5T8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ccdc113Q8C5T8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc113Q8C5T8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccdc113Q8C5T8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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