Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ska3Q8C263 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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